এমপিওভুক্ত আলিয়া মাদ্রাসাসমূহের শিক্ষক-কর্মচারীদের এমপিওর (বেতন-ভাতার সরকারি অংশ) দায়িত্ব মাদ্রাসা শিক্ষা অধিদপ্তরের হাতে হস্তান্তর করা হয়েছে। এপ্রিল মাসের বেতন-ভাতার চেক ব্যাংকে পাঠানোসহ যাবতীয় কাজ করবেন মাদ্রাসা শিক্ষা অধিদপ্তরের কর্মকর্তাগণ্।
মাদ্রাসা অধিদপ্তরের মহাপরিচালক মো: বিল্লাল হোসনে জানান, মঙ্গলবার (২রা এপ্রিল) শিক্ষা অধিদপ্তরের দুজন পরিচালক ও উপ-পরিচালকের কাছ থেকে তিনি সব বিষয় বুঝে নিয়েছেন।
রাজধানীর ইস্কাটনে রেড-ক্রিসেন্ট বোরাক টাওয়ারে মাদ্রাসা শিক্ষা অধিদপ্তরের অবস্থান।
শিক্ষা অধিদপ্তরের তথ্যমতে, মোট এমপিওভুক্ত মাদ্রাসার সংখ্যা সাত হাজার ৬শ ১৮াট। এমপিওভুক্ত শিক্ষক এক লাখ একুশ হাজার ৩৮১ ও কর্মচারী ২৬ হাজার ৮৬৪জন।